KJM3350 – Proteinkrystallografi
Beskrivelse av emnet
Kort om emnet
Symmetri, romgrupper, krystaller og krystallisering, diffraksjon, Braggs lov, Fouriersyntese og Fourieranalyse, faseproblemet. Instrumenter, dataopptak og datareduksjon. Strukturl?sning ved multiple isomorphous replacement (MIR), multiple anomalous dispersion (MAD) og molecular replacement (MR). Pattersonfunksjon, Pattersonkart og elektrontetthetskart. Raffinering og validering. Databaser. Lese og forst? en krystallografisk artikkel.
Hva l?rer du?
Kurset vil gi en grundig innf?ring i strukturbestemmelse av proteiner med r?ntgendiffraksjon. Metoden vil i korthet bli sammenlignet med andre makromolekylstrukturbestemmelsesmetoder som elektrondiffraksjon og kjernemagnetisk resonans (NMR). Det er meningen at kursdeltagerne skal forst? og kunne vurdere moderne forskningslitteratur innen fagfeltet. Kurset best?r av en teoretisk del som dekker de fleste aspektene av proteinkrystallografien, og en praktisk del med praktiske ?velser: proteinkrystallisering, dataopptak, modellbygging og validering av proteinstrukturen samt enkle databases?k.
Opptak og adgangsregulering
Studenter m? hvert semester s?ke og f? plass p? undervisningen og melde seg til eksamen i Studentweb.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du s?ke opptak til v?re studieprogrammer, eller s?ke om ? bli enkeltemnestudent.
Forkunnskaper
Obligatoriske forkunnskaper
I tillegg til generell studiekompetanse m? du ha best?tt enten 2MX, 2MY eller 3MZ, og enten 3MX, 3FY, 3KJ, 3BI, eller emnekombinasjonen 2KJ+3BT eller emnekombinasjonen 2BI+3BT fra videreg?ende skole. Les mer om mulighetene for ? dekke fagkrav p? andre m?ter enn med fag fra norsk videreg?ende skole.
Anbefalte forkunnskaper
Det er en fordel ? ha noe kunnskap om proteiner og grunnleggende matematiske kunnskaper.
Overlappende emner
Emnet overlapper 9 studiepoeng med KJ-KJB234, 10 studiepoeng med KJM5300, og 10 studiepoeng mot KJM4350
Undervisning
Kurset best?r av 27 timer forelesninger, 30 timer obligatoriske regne?velser og diskusjonskollokvier, 8 timer obligatoriske laboratorie?velser, og en obligatorisk litteraturoppgave som studentene m? b?de presentere muntlig og levere inn skriftlig. Prosjektoppgavene (Laboratoriekurset og litteraturoppgaven) m? v?re godkjente f?r du kan g? opp til eksamen.
Det er obligatorisk oppm?te til f?rste forelesning. Du mister plassen p? emnet dersom gyldig forfall til f?rste forelesning ikke er meldt til Kjemisk institutts ekspedisjonskontor, tlf. 22 85 54 46, f?r forelesningen starter.
Eksamen
Presentasjon av litteraturoppgave, b?de muntlig og skriftlig. Deltagelse p? teoretiske ?velser og diskusjons?kt. Skriftlig oppsummering av laboratorieoppgaver (maksimalt 2 siders rapport). Muntlig eksamen. Bokstavkarakter (A-F).
Informasjon om utsatt eksamen / ny eksamen finner du her: /studier/admin/eksamen/sykdom-utsatt/mn/index.html
Mer informasjon om eksamen ved MN-fakultetet kan du lese p? eksamenssidene: http://www.matnat.uio.no/studier/eksamen/index.html
Annet
Undervisningen i emnet vil kanselleres dersom f?rre enn 3 studenter melder seg innen emneopptaket.
Eventuelle teoretiske obligatoriske oppgaver er kun gyldig det semesteret de ble godkjent.