BIOS4000 – Design og analyse av biologiske studier
Beskrivelse av emnet
Kort om emnet
Emnet gir en grundig innf?ring i viktige aspekter rundt design av biologiske studier og statistisk analyse i biologi. Det legges vekt p? bruk av statistiske modeller for ? kunne trekke slutninger om biologiske m?nstre og prosesser. Gjennom prosjektarbeid, regne?velser og data?velser f?r du grunnleggende ferdigheter i moderne biologisk forskning. Det statistiske programmeringsmilj?et R benyttes gjennom hele kurset.
Hva l?rer du?
Etter ? ha fullf?rt emnet forventes du ha f?lgende kompetanse:
- Forst? forskjellen mellom observasjonsstudier og eksperimenter, og kunne vurdere resultater fra ulike typer studier i en biologisk sammenheng.
- Forst? betydningen av begrepene pseudoreplikasjon, sammenblanding (konfundering), eksperimentell kontroll, randomisering, sampling skjevhet, stratifisert sampling og blokking i sammenheng med planlegging og analyse av biologiske studier.
- Kunne utf?re Monte Carlo-simuleringer for ? vurdere ulike studiedesigner og statistiske modeller.
- Kunne tilpasse biologisk relevante modeller basert p? normalfordeling, binomisk fordeling og Poisson-fordeling (GLM), og kunne beregne line?re kontraster og prediksjoner med konfidensintervaller fra disse tilpasningene, samt ? kunne vurdere hvor godt disse modellene passer til data.
- Kunne tilpasse hierarkiske modeller med normalfordelte responsvariabler og tolke disse.
- Kunne vurdere kilder til forventningsskjevhet i modeller som tilpasses biologiske data, herunder effekter av sampling skjevhet, m?lefeil i forklaringsvariabler (attenuasjon) og frafall av studieenheter gjennom studiets forl?p.
- Ha kjennskap til vanlige tankefeil i tolkning av statistiske analyser.
- Ha kjennskap til prinsipper for valg av modell som er best egnet for ? besvare spesifikke forskningssp?rsm?l.
- Kunne forst? og sette seg inn litteratur som bygger p? kursets innhold og kunne presentere dette muntlig p? en pedagogisk m?te for medstudenter.
Opptak til emnet
Studenter tatt opp til andre masterprogrammer kan, etter s?knad, f? adgang til emnet hvis dette er klarert med eget program.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du s?ke om opptak til v?re?studieprogrammer, eller s?ke om ??bli enkeltemnestudent.
Emnene BIOS3000?og BIOS4000?har felles opptak. S?kere rangeres etter f?lgende kriterier:
1. Bachelorprogramstudenter ved Institutt for biovitenskap og masterprogramstudenter ved MN-fakultetet som har emnet i sin godkjente studieplan.
2.? Andre programstudenter.
3. Enkeltemne- og utvekslingsstudenter.
S?kere rangeres etter studiepoeng i hver gruppe; alle s?kere innenfor 1. rangeres f?r s?kere i 2. osv. For studenter som stiller likt ved plassbegrensing innenfor hver enkelt gruppe blir opptak avgjort ved loddtrekning.
Emnene har 40 plasser.
Obligatoriske forkunnskaper
STK1000 – Innf?ring i anvendt statistikk eller tilsvarende.
Anbefalte forkunnskaper
Element?re forkunnskaper i? programmering tilsvarende innholdet i BIOS1100 – Innf?ring i beregningsmodeller for biovitenskap (nedlagt) er sterkt anbefalt.?
Andre anbefalte forkunnskaper er? BIOS1110 – Celle- og molekyl?rbiologi, BIOS1120 – Fysiologi, BIOS1140 – Evolusjon og genetikk og BIOS2100 – Generell ?kologi.
Overlappende emner
- 10 studiepoeng overlapp med BIOS3000 – Design og analyse av biologiske studier.
- 10 studiepoeng overlapp med BIO2150 – Biostatistikk og studiedesign (nedlagt).
- 10 studiepoeng overlapp med BIO2130 – Biostatistikk (nedlagt).
- 10 studiepoeng overlapp med BIO2110 – Eksperimentell ?kologi (nedlagt).
Undervisning
Emnet best?r av:
Forelesninger
Oppgave-l?sning med veiledning
Obligatoriske innleveringer
Et obligatorisk litteraturstudium med muntlig forelesning for medstudenter (individuelt eller i grupper av 2)
Alt kursmateriell er p? engelsk og alle rapporter m? skrives p? engelsk.
Det er obligatorisk oppm?te til f?rste forelesning for studenter som skal f?lge undervisning i emnet. Dette gjelder ogs? for studenter p? venteliste. Du mister plassen p? emnet dersom?forfall til f?rste forelesning ikke er meldt til?studieinfo@ibv.uio.no?, f?r forelesningen starter.
Alle obligatoriske aktiviteter m? v?re godkjente for ? kunne g? opp til eksamen.?
Godkjente obligatoriske aktiviteter?er gyldige i 3??r.
Adgang til undervisning: Dersom du har?gjennomf?rt og f?tt godkjent obligatorisk undervisning, har du ikke krav p? ny undervisning. Dersom du har f?tt undervisningsopptak til emnet, men ikke har gjennomf?rt eller f?tt godkjent obligatorisk undervisning, har du?rett til ny undervisning n?r det er ledig?kapasitet.
Eksamen
Avsluttende skriftlig eksamen?som teller 100% av karakteren.
Dette emnet har obligatoriske ?velser som m? v?re godkjent f?r avsluttende eksamen.?
Som eksamensfors?k i dette emnet teller ogs? fors?k i f?lgende tilsvarende emner: BIOS3000 – Design og analyse av biologiske studier, BIO2150 – Biostatistikk og studiedesign (nedlagt), BIO2130 – Biostatistikk (nedlagt), BIO2110 – Eksperimentell ?kologi (nedlagt).
Hjelpemidler til eksamen
Ingen hjelpemiddel tillatt. Kalkulator vil v?re tilgjengelig i Inspera under eksamen.
Eksamensspr?k
Du kan besvare eksamen p? norsk, svensk, dansk eller engelsk.
Karakterskala
Emnet bruker?karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen.
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Studenter som dokumenterer gyldig frav?r fra ordin?r eksamen, kan ta?utsatt eksamen i starten av neste semester.
Det tilbys ikke ny eksamen til studenter som har trukket seg under ordin?r eksamen, eller som ikke har best?tt.
Mer om eksamen ved UiO
- Kildebruk og referanser
- Hvordan bruke KI som student
- Tilrettelegging p? eksamen
- Trekk fra eksamen
- Syk p? eksamen / utsatt eksamen
- Begrunnelse og klage
- Ta eksamen p? nytt
- Fusk/fors?k p? fusk
Andre veiledninger og ressurser finner du p? fellessiden om eksamen ved UiO.